Over het algemeen kun je het beste de loonheffingskorting toe laten passen bij de werkgever of uitkeringsinstantie waar je het meest verdient. Je maakt dan volledig gebruik van deze regeling.
De loonheffingskorting mag maar door 1 werkgever of uitkeringsinstantie tegelijkertijd worden toegepast. Als de loonheffingskorting dubbel wordt toegepast, betaal je te weinig belasting. Het verschil zul je later alsnog moeten terugbetalen aan de Belastingdienst. Wordt de loonheffingskorting dus al door een uitkeringsinstantie of werkgever toegepast, dan kun je hier beter niet nogmaals voor kiezen.
Je kunt er ook om een andere reden voor kiezen om geen loonheffingskorting toe te laten passen. Je betaalt dan mogelijk wel te veel belasting. Aan het eind van het kalenderjaar kun je de Belastingdienst vragen om een teruggaaf van de belastingen die je te veel hebt betaald.